《斯坦因敦煌考古檔案研究》是一部研究斯坦因手稿的敦煌考古學史專著，系2019年度國家出版基金項目、國家社科基金重大項目成果，2020年1月由敦煌文藝出版社出版發行。

本書論述了近代敦煌考古學的起源，斯坦因敦煌考古之前的中亞考察活動，斯坦因1907年和1914年在敦煌莫高窟的考古活動，以及他與當地官員及民眾的交往活動。

與同類著作主要依賴斯坦因第二、第三次中亞考察報告書不同，該書的參考資料是牛津大學包德利圖書館特藏品和西方寫本部所藏的“斯坦因手稿”，其中斯坦因1907年和1914年敦煌莫高窟考古日記是斯坦因生前撰寫、刊布其中亞考察各種游記、報告書、論著的主要依據，也是后人研究斯坦因莫高窟考古活動、了解英藏敦煌文獻獲取過程的最原始資料；故能更真實地反映斯坦因敦煌考古的情況。本書利用權威一手檔案進行研究，反映了我國敦煌考古學史領域的新近研究成果。作者多年來一直研究斯坦因中亞考古問題，在此領域獨具建樹，其研究成果受到國內外學界的高度評價。這保證了該書的科學性、權威性。

本書獲第八屆中華優秀出版物圖書獎。